ENQUIRE PROJECT DETAILS BY GENERAL PUBLIC

Project Details
Funding Scheme : General Research Fund
Project Number : 16213121
Project Title(English) : Identifying targets for a cross-coronavirus vaccine using intelligent computational techniques 
Project Title(Chinese) : 使用智能計算技術開發交叉冠狀病毒的疫苗靶標 
Principal Investigator(English) : Dr Quadeer, Ahmed Abdul 
Principal Investigator(Chinese) :  
Department : Dept of Electronic & Computer Engineering
Institution : The Hong Kong University of Science and Technology
Co - Investigator(s) :
Prof McKay, Matthew R.
Panel : Engineering
Subject Area : Electrical & Electronic Engineering
Exercise Year : 2021 / 22
Fund Approved : 838,393
Project Status : On-going
Completion Date : 31-8-2024
Abstract as per original application
(English/Chinese):

在過去的20年裏,我們目睹了三次由冠狀病毒引起的疫情。這些病毒包括嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒(SARS-CoV)、中東呼吸綜合症冠狀病毒(MERS-CoV)和正在流行的新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)。所有這些冠狀病毒都被懷疑起源於蝙蝠,並通過中間動物宿主最終感染人類。為了預防未來尚未被發現的冠狀病毒再次引起致命的大流行,開發一種對人類和蝙蝠冠狀病毒都有效的交叉冠狀病毒疫苗是很重要的。 該項目將利用智能計算技術,同時利用現有和未來新出現的冠狀病毒遺傳和免疫學數據,協助交叉冠狀病毒疫苗研發的第一階段,即識別冠狀病毒基因組中被稱為“抗原表位”的特定部分,這些部分是人類的免疫細胞識別並攻擊和殺死病毒的重要目標。設計這種疫苗的主要挑戰是找到同時存在於人類和蝙蝠冠狀病毒的中的抗原表位,並且這些抗原表位無法逃離(通過基因突變)攻擊它們的免疫細胞,同時這些抗原表位能被大部分人類群體的免疫細胞識別。 PI和Co-PI 之前通過高效的計算工具,針對艾滋病毒、丙型肝炎病毒、登革熱病毒和新型冠狀病毒病毒,開發出了能夠被免疫系統識別,同時誘導出強大免疫反應的抗原表位。儘管通過這些計算工具已經為多種病毒都提供了可靠的結果,但是這些工具還沒有被用於研究冠狀病毒家族。建立在PI和Co-PI現有工作的基礎上,該項目將應用機器學習、高維統計、信息論和統計物理的新方法來研究冠狀病毒家族。 本項目將應用目前預測人類冠狀病毒抗原表位的最準確的方法開發出一個比較系統。該系統將首先提出一組初步的候選的抗原表位。同時,該系統將同步冠狀病毒免疫學的最新數據,這些數據將由本項目在初步的研究中開發的匯集這些新興數據的數據庫提供。為了從初步候選的抗原表位中篩選出不受病毒遺傳變異影響的抗原表位,本項目將採用基於PI和Co-PI之前的工作的更加保守的估算方法進行篩選。之後該系統將進行人類不同群體間的免疫系統類型分布的統計,以進一步篩選能被全球以及特定區域中大部分人群的免疫系統識別的抗原表位。最終這一經過篩選的抗原表位集將被推薦為可能有效對抗人類和蝙蝠冠狀病毒的疫苗靶標。
Research Outcome
Layman's Summary of
Completion Report:
Not yet submitted

  SCREEN ID: SCRRM00542